A pesar de que registró una disminución en el porcentaje de alumnos que abandonaron sus estudios de secundaria en el último ciclo escolar, Jalisco se mantiene entre los primeros doce estados del país con un alto índice de deserción escolar en ese nivel educativo.
La Secretaría de Educación del Estado (SEJ) presentó como un resultado positivo en el Libro del IV Informe de Gobierno de Aristóteles Sandoval Díaz que en el ciclo escolar 2015-2016 sólo el 4.76% de los alumnos de secundaria desertaron de sus estudios.
Este porcentaje es menor al obtenido en el ciclo escolar 2014-2015 cuando el 4.98% de los estudiantes abandonaron las aulas.
Desde el año 2012 se muestra una baja en el índice de abandono de los estudios de secundaria en Jalisco, ya que este índice fue de 6.55%, mientras un año antes había sido de 6.9%.
Para el año 2013 este índice se ubicó en 5.59%, y para el año siguiente fue de 5.31%.
Las tres entidades con menor porcentaje de abandono escolar en el nivel secundaria son Aguascalientes (1.74%), Tlaxcala (3.42%) y Morelos (2.96%).